More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0001 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
449 aa  921  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  63.96 
 
 
450 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  65.16 
 
 
446 aa  588  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  64.48 
 
 
446 aa  584  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  64.21 
 
 
450 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  64.48 
 
 
446 aa  584  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  64.48 
 
 
446 aa  583  1e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  64.48 
 
 
446 aa  583  1e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  64.48 
 
 
446 aa  583  1e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  64.48 
 
 
446 aa  583  1e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  64.99 
 
 
446 aa  582  1e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  64.99 
 
 
446 aa  581  1e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  64.48 
 
 
446 aa  583  1e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  63.12 
 
 
446 aa  575  1e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  63.03 
 
 
453 aa  576  1e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  62.79 
 
 
441 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  59.73 
 
 
442 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.33 
 
 
463 aa  544  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  58.67 
 
 
457 aa  540  1e-152  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  58.67 
 
 
457 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  58.96 
 
 
440 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  61.78 
 
 
443 aa  517  1e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.59 
 
 
446 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.59 
 
 
454 aa  506  1e-142  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.26 
 
 
444 aa  505  1e-142  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  57.14 
 
 
445 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  55.45 
 
 
443 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.29 
 
 
443 aa  493  1e-138  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  53.95 
 
 
436 aa  492  1e-138  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  53.74 
 
 
453 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  53.74 
 
 
453 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  53.03 
 
 
451 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.11 
 
 
450 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.89 
 
 
456 aa  447  1e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  48.37 
 
 
472 aa  446  1e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.22 
 
 
453 aa  438  1e-122  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  48.16 
 
 
449 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  48.41 
 
 
481 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  48.28 
 
 
450 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  49.15 
 
 
480 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  48.84 
 
 
445 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.21 
 
 
454 aa  428  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  47.17 
 
 
478 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  48.65 
 
 
452 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.11 
 
 
461 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  49.32 
 
 
453 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  44.54 
 
 
458 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.25 
 
 
439 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  44.4 
 
 
460 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  45.2 
 
 
482 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.99 
 
 
447 aa  415  1e-115  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  46.83 
 
 
462 aa  416  1e-115  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  46.61 
 
 
462 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  47.03 
 
 
460 aa  418  1e-115  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  46.61 
 
 
462 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  46.09 
 
 
460 aa  417  1e-115  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  46.61 
 
 
462 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  46.61 
 
 
462 aa  416  1e-115  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  46.71 
 
 
461 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.67 
 
 
480 aa  415  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  46.71 
 
 
461 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  46.49 
 
 
461 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  46.82 
 
 
460 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  46.82 
 
 
460 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  45.45 
 
 
459 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  47.52 
 
 
453 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  46.82 
 
 
460 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  46.59 
 
 
460 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  47.3 
 
 
453 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.03 
 
 
439 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  47.22 
 
 
456 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  45.02 
 
 
462 aa  407  1e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.03403e-07  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  46.38 
 
 
457 aa  408  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.24276e-07  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  45.93 
 
 
462 aa  407  1e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  44.61 
 
 
466 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
467 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
467 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.86 
 
 
447 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  44.57 
 
 
452 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  44.57 
 
 
452 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
467 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  44.09 
 
 
467 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.71 
 
 
465 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.09 
 
 
467 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  44.28 
 
 
465 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  44.3 
 
 
467 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  44.61 
 
 
466 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  44.61 
 
 
466 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  44.61 
 
 
466 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  44.61 
 
 
466 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  45.56 
 
 
459 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.81636e-06  unclonable  3.44978e-06 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
467 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
467 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.94 
 
 
483 aa  399  1e-110  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  58.41 
 
 
494 aa  400  1e-110  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  49.42 
 
 
495 aa  400  1e-110  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  49.42 
 
 
495 aa  400  1e-110  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  49.42 
 
 
495 aa  400  1e-110  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  47.42 
 
 
451 aa  401  1e-110  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.39 
 
 
587 aa  399  1e-110  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>