78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3103 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  100 
 
 		 531 aa  1075    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  68.41 
 
 		 532 aa  711    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  60.67 
 
 		 527 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  55.6 
 
 		 532 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  57.49 
 
 		 537 aa  528  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  55.08 
 
 		 549 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.07 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  49.41 
 
 		 595 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  52.34 
 
 		 538 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  49.6 
 
 		 568 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  51.28 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  45.72 
 
 		 534 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  46.72 
 
 		 619 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  40.12 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  46.41 
 
 		 621 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 661 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  26.73 
 
 		 669 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  26.16 
 
 		 679 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  26.01 
 
 		 679 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  28.14 
 
 		 660 aa  136  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 676 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  25.89 
 
 		 675 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  25.61 
 
 		 692 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  27.45 
 
 		 696 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  27.3 
 
 		 696 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  27.94 
 
 		 584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  24.89 
 
 		 691 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  28.28 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  27.97 
 
 		 582 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  28.22 
 
 		 595 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  26.26 
 
 		 595 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  26.13 
 
 		 599 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  28.16 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  25.4 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  24.91 
 
 		 748 aa  77.4  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  25.5 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30.72 
 
 		 624 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  29.38 
 
 		 606 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  31.78 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  30.26 
 
 		 600 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  22.98 
 
 		 672 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.24 
 
 		 600 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  28.86 
 
 		 764 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  27.64 
 
 		 757 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.1 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  26.63 
 
 		 764 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  28.57 
 
 		 797 aa  60.1  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  23.82 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  29.58 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  21.4 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  22.39 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  27.32 
 
 		 758 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  30.34 
 
 		 454 aa  57  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  25.94 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  28.68 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  22.46 
 
 		 531 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  24.61 
 
 		 549 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  22.68 
 
 		 680 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.38 
 
 		 641 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  21 
 
 		 595 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  31.88 
 
 		 784 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  26.89 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  20.09 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  28.72 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.55 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.6 
 
 		 722 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.59 
 
 		 618 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  27.45 
 
 		 547 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  27.36 
 
 		 761 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14670  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  21.57 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2127  heterodisulfide reductase, putative  51.35 
 
 		 411 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1648  heterodisulfide reductase, subunit A  48 
 
 		 427 aa  45.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0282926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  45.45 
 
 		 623 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  26.97 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1923  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  31.51 
 
 		 463 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>