160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3018 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 678 aa  1397    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  24.93 
 
 		 2274 aa  100  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  25.43 
 
 		 763 aa  98.2  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  24.86 
 
 		 2077 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  26.63 
 
 		 1669 aa  97.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  24.16 
 
 		 1606 aa  97.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  23.68 
 
 		 1726 aa  96.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  22.87 
 
 		 1575 aa  94.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  24.27 
 
 		 1925 aa  94.7  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  26.25 
 
 		 1642 aa  94  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  24.06 
 
 		 761 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  25.23 
 
 		 1669 aa  90.5  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  24.5 
 
 		 2098 aa  88.2  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  24.73 
 
 		 1649 aa  85.5  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  29.01 
 
 		 1693 aa  85.5  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 2570 aa  83.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  22.15 
 
 		 1706 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  24.02 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  32.17 
 
 		 1703 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  33.33 
 
 		 1697 aa  77.8  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  29.71 
 
 		 1956 aa  77.8  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  32.39 
 
 		 1700 aa  77  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 1516 aa  76.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  23.36 
 
 		 1594 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  24.66 
 
 		 2005 aa  76.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  22.6 
 
 		 976 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1748 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  28.96 
 
 		 1702 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  33.33 
 
 		 1701 aa  75.5  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  31.21 
 
 		 1697 aa  74.7  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  23.26 
 
 		 2117 aa  74.3  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 1674 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  24.34 
 
 		 1932 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  36.46 
 
 		 766 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  22.79 
 
 		 1934 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  24.84 
 
 		 1722 aa  62.4  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  37.97 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  27.45 
 
 		 1096 aa  58.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.91 
 
 		 933 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.93 
 
 		 969 aa  54.3  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  38.16 
 
 		 894 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  30.19 
 
 		 1417 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  33.81 
 
 		 1160 aa  53.9  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  28.35 
 
 		 988 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  20.83 
 
 		 1379 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25.64 
 
 		 971 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  25.25 
 
 		 1141 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  31.03 
 
 		 922 aa  52.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  34.09 
 
 		 946 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  41.94 
 
 		 1160 aa  51.2  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  25.86 
 
 		 1025 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.26 
 
 		 1169 aa  50.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 1170 aa  50.8  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  24.32 
 
 		 1046 aa  50.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  38.46 
 
 		 940 aa  50.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  30 
 
 		 915 aa  50.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  26.42 
 
 		 1064 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.52 
 
 		 900 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.19 
 
 		 1169 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 986 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  32.29 
 
 		 945 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 1147 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  25.85 
 
 		 1202 aa  49.3  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.3 
 
 		 1212 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  27.03 
 
 		 948 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  26.04 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 		 1002 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1037 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  26.04 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  26.04 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  26.04 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  34.07 
 
 		 541 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  44.19 
 
 		 840 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  26.04 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 1177 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  33.78 
 
 		 952 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  37.5 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32 
 
 		 1028 aa  48.5  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.45 
 
 		 969 aa  48.1  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  25.37 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  31.75 
 
 		 1194 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  32.47 
 
 		 1170 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  35.96 
 
 		 906 aa  48.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  32.29 
 
 		 941 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  33.78 
 
 		 969 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.89 
 
 		 1201 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 1201 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  40 
 
 		 1045 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  40 
 
 		 1046 aa  47.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  30.19 
 
 		 1038 aa  47.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  36 
 
 		 774 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  23.91 
 
 		 513 aa  47.4  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.54 
 
 		 949 aa  47.4  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  34.21 
 
 		 760 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  38 
 
 		 1058 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  39.62 
 
 		 958 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  40 
 
 		 1031 aa  47  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  36.84 
 
 		 953 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  37.29 
 
 		 958 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>