224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3000 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  87.83 
 
 
575 aa  1023    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  100 
 
 
575 aa  1177    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  67.07 
 
 
585 aa  779    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  67.07 
 
 
585 aa  779    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  40.48 
 
 
580 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  41.75 
 
 
582 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  38.94 
 
 
581 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  38.25 
 
 
584 aa  359  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  40.14 
 
 
609 aa  351  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  37.69 
 
 
581 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  37.69 
 
 
581 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  40.45 
 
 
671 aa  346  8.999999999999999e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  39.93 
 
 
589 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  40.1 
 
 
584 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  38.12 
 
 
584 aa  339  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  40.34 
 
 
585 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  37.61 
 
 
584 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  34.95 
 
 
663 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  32.96 
 
 
689 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  32.11 
 
 
467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  32.51 
 
 
464 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  32.3 
 
 
464 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  31.73 
 
 
434 aa  160  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  31.95 
 
 
434 aa  160  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  33.92 
 
 
464 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  32.03 
 
 
455 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  35.57 
 
 
450 aa  156  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  30.96 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  30.96 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  30.96 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  31.16 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  31.16 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  30.96 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  28.21 
 
 
557 aa  153  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  31.16 
 
 
467 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  28.88 
 
 
557 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  28.63 
 
 
553 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  28.02 
 
 
557 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  28.02 
 
 
557 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  28.02 
 
 
557 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  37.8 
 
 
426 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  30.82 
 
 
466 aa  151  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  29.78 
 
 
518 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  29.14 
 
 
467 aa  150  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  32.73 
 
 
471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  30.08 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  32.54 
 
 
468 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  30.69 
 
 
478 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  29.78 
 
 
505 aa  146  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  31.2 
 
 
548 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  28.9 
 
 
557 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  30.45 
 
 
463 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  28.95 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  34.85 
 
 
530 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  29.3 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  33.02 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  33.02 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  30.21 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  28.57 
 
 
557 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  33.64 
 
 
558 aa  140  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  34.15 
 
 
541 aa  140  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  34.09 
 
 
480 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  28.63 
 
 
532 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  28.63 
 
 
546 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  28.48 
 
 
489 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  31.21 
 
 
478 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  27.94 
 
 
543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  27.7 
 
 
557 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  28.43 
 
 
546 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  28.16 
 
 
545 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  33.49 
 
 
611 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  28.37 
 
 
545 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  28.37 
 
 
545 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  28.37 
 
 
545 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  28.33 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.62 
 
 
525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  28.16 
 
 
546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  27.84 
 
 
486 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  32.61 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.01 
 
 
525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  29.76 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  28.06 
 
 
543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  29.2 
 
 
589 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  30.27 
 
 
557 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  27.9 
 
 
616 aa  130  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  27.11 
 
 
498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.63 
 
 
436 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  28.72 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  27.63 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  27.11 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  27.2 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  27.07 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  32.48 
 
 
476 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  27.44 
 
 
545 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  28.66 
 
 
502 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  31.34 
 
 
454 aa  127  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
471 aa  127  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  31.34 
 
 
481 aa  126  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  32.38 
 
 
509 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  32.38 
 
 
476 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>