More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2916 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  100 
 
 
472 aa  969    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  64.33 
 
 
481 aa  613  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  47.23 
 
 
588 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  46.58 
 
 
589 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  45.7 
 
 
459 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  45.12 
 
 
574 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  47.79 
 
 
587 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  44.04 
 
 
477 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  43.31 
 
 
481 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  43.45 
 
 
481 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  44.11 
 
 
586 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  41.74 
 
 
586 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  42.3 
 
 
586 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  41.74 
 
 
586 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  41.52 
 
 
586 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  41.52 
 
 
586 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  43.11 
 
 
582 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  41.52 
 
 
586 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  41.09 
 
 
586 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  41.3 
 
 
586 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  41.9 
 
 
586 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  41.3 
 
 
586 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  41.52 
 
 
586 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  40.82 
 
 
484 aa  355  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  40.73 
 
 
663 aa  348  1e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  40.6 
 
 
481 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  40.6 
 
 
610 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  40.59 
 
 
584 aa  335  7.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  41.22 
 
 
496 aa  335  9e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  40.6 
 
 
610 aa  335  9e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  40.47 
 
 
486 aa  335  9e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  42.58 
 
 
574 aa  333  5e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  41.65 
 
 
493 aa  331  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  44.5 
 
 
578 aa  325  8.000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  40.98 
 
 
589 aa  324  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  40.22 
 
 
487 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  41.78 
 
 
481 aa  316  7e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  39.46 
 
 
488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  36.29 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  36.29 
 
 
486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  38.71 
 
 
476 aa  298  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  39.01 
 
 
483 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  39.95 
 
 
583 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  35.61 
 
 
575 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  36.45 
 
 
614 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  40.25 
 
 
480 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  37.65 
 
 
576 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  34.53 
 
 
1401 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  34.06 
 
 
1847 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  33.75 
 
 
1401 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  35.4 
 
 
617 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  33.5 
 
 
611 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  35.99 
 
 
703 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  33.57 
 
 
1753 aa  252  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  35.44 
 
 
580 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  32.87 
 
 
1307 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  37.29 
 
 
473 aa  249  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  37.29 
 
 
473 aa  249  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  32.58 
 
 
914 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  35.28 
 
 
576 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  32.14 
 
 
1643 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  36.88 
 
 
605 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  35.81 
 
 
600 aa  243  7e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  36.66 
 
 
605 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  36.66 
 
 
605 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  36.66 
 
 
604 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  36.66 
 
 
605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  36.66 
 
 
605 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  36.66 
 
 
605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  36.66 
 
 
605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  35.9 
 
 
607 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  36.82 
 
 
605 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  36.38 
 
 
605 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  36.38 
 
 
605 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  36.3 
 
 
644 aa  239  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  36.87 
 
 
475 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.56 
 
 
1193 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  32.12 
 
 
608 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  35.7 
 
 
605 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  35.89 
 
 
605 aa  233  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  33.19 
 
 
715 aa  232  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  31.11 
 
 
1299 aa  230  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  34.5 
 
 
609 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  34.5 
 
 
609 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  30.16 
 
 
606 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  34.4 
 
 
608 aa  226  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  30.14 
 
 
659 aa  226  9e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.1 
 
 
1175 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  32.43 
 
 
474 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  32.68 
 
 
651 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  32.16 
 
 
479 aa  208  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  31.47 
 
 
1145 aa  206  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  32.22 
 
 
647 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  32.69 
 
 
624 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  31.49 
 
 
463 aa  199  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  32.3 
 
 
569 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  34.05 
 
 
511 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  32.96 
 
 
510 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  31.18 
 
 
634 aa  193  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3720  alpha amylase, catalytic region  32.97 
 
 
468 aa  193  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>