184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2850 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2383  potassium-transporting ATPase subunit A  69.68 
 
 
567 aa  754    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959423  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2850  potassium-transporting ATPase subunit A  100 
 
 
568 aa  1123    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5925  potassium-transporting ATPase subunit A  68.45 
 
 
568 aa  735    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6747  potassium-transporting ATPase subunit A  52.47 
 
 
567 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194122  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1155  potassium-transporting ATPase subunit A  55.26 
 
 
569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0954  potassium-transporting ATPase subunit A  54.64 
 
 
571 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3776  potassium-transporting ATPase subunit A  53.89 
 
 
567 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0662  potassium-transporting ATPase subunit A  54.53 
 
 
567 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5835  potassium-transporting ATPase subunit A  52.47 
 
 
567 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.069816  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4550  potassium-transporting ATPase subunit A  53.46 
 
 
567 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0177  potassium-transporting ATPase subunit A  55.08 
 
 
571 aa  568  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133184  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6074  potassium-transporting ATPase subunit A  53.33 
 
 
569 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3413  potassium-transporting ATPase subunit A  53.64 
 
 
567 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6338  potassium-transporting ATPase subunit A  52.02 
 
 
567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2275  potassium-transporting ATPase subunit A  52.09 
 
 
579 aa  564  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0193  potassium-transporting ATPase subunit A  54.64 
 
 
571 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3240  potassium-transporting ATPase subunit A  52.37 
 
 
571 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.47874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0209  potassium-transporting ATPase subunit A  52.05 
 
 
571 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202017  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4645  potassium-transporting ATPase subunit A  53.09 
 
 
567 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1468  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.17 
 
 
567 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.084132  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2994  potassium-transporting ATPase subunit A  52.57 
 
 
567 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1871  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.26 
 
 
582 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0874  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.58 
 
 
572 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.481077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2826  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.97 
 
 
569 aa  535  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0233  potassium-transporting ATPase subunit A  54.72 
 
 
571 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2507  K+ transporting ATPase A chain  51.23 
 
 
576 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11047  potassium-transporting ATPase subunit A  49.82 
 
 
571 aa  535  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0251  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.36 
 
 
562 aa  528  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4995  potassium-transporting ATPase subunit A  51.99 
 
 
575 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2217  potassium-transporting ATPase subunit A  50.67 
 
 
595 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.631048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1479  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.03 
 
 
568 aa  524  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1087  potassium-transporting ATPase subunit A  47.77 
 
 
592 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0038  potassium-transporting ATPase subunit A  50.91 
 
 
610 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5358  potassium-transporting ATPase subunit A  53.36 
 
 
569 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267227  normal  0.0726113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3382  potassium-transporting ATPase subunit A  47.47 
 
 
590 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0895  potassium-transporting ATPase subunit A  52.3 
 
 
578 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43400  potassium-transporting ATPase subunit A  51.5 
 
 
564 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0355  potassium-transporting ATPase subunit A  49.92 
 
 
601 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3640  potassium-transporting ATPase subunit A  51.68 
 
 
564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  48.1 
 
 
578 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3604  potassium-transporting ATPase subunit A  48.87 
 
 
599 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.894614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0624  potassium-transporting ATPase subunit A  50.46 
 
 
555 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0265088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3230  potassium-transporting ATPase subunit A  49.02 
 
 
574 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1227  potassium-transporting ATPase subunit A  46.97 
 
 
592 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1130  potassium-transporting ATPase subunit A  49.29 
 
 
561 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0510  potassium-transporting ATPase subunit A  49.83 
 
 
591 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328065  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1159  potassium-transporting ATPase subunit A  49.03 
 
 
562 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3267  potassium-transporting ATPase subunit A  47.64 
 
 
590 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.749431  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1108  potassium-transporting ATPase subunit A  49.11 
 
 
562 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3582  potassium-transporting ATPase subunit A  49.03 
 
 
562 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2326  potassium-transporting ATPase subunit A  47.32 
 
 
601 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3589  potassium-transporting ATPase subunit A  47.14 
 
 
590 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122147  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4534  potassium-transporting ATPase subunit A  50.36 
 
 
555 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.323384  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0809  potassium-transporting ATPase subunit A  51.63 
 
 
555 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000041041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2293  potassium-transporting ATPase subunit A  48.91 
 
 
605 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2311  potassium-transporting ATPase subunit A  46.72 
 
 
601 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0797  potassium-transporting ATPase subunit A  50.18 
 
 
555 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.232104  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2204  potassium-transporting ATPase subunit A  47.06 
 
 
601 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.891481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0990  potassium-transporting ATPase subunit A  47.39 
 
 
601 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0654  potassium-transporting ATPase subunit A  51.63 
 
 
555 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000280629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0894  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 
555 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000369924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0703  potassium-transporting ATPase subunit A  51.24 
 
 
555 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000479775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0647  potassium-transporting ATPase subunit A  51.63 
 
 
555 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000038311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0646  potassium-transporting ATPase subunit A  51.24 
 
 
555 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000509464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0815  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 
555 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03991e-48 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5615  potassium-transporting ATPase subunit A  46.99 
 
 
601 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0739  potassium-transporting ATPase subunit A  51.24 
 
 
555 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1676  potassium-transporting ATPase subunit A  46.72 
 
 
601 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2288  potassium-transporting ATPase subunit A  46.72 
 
 
601 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2242  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.18 
 
 
564 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00752993  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2091  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.3 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3733  potassium-transporting ATPase subunit A  49.56 
 
 
564 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0754  potassium-transporting ATPase subunit A  50.57 
 
 
559 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0864  potassium-transporting ATPase subunit A  50.57 
 
 
559 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1670  potassium-transporting ATPase subunit A  44.71 
 
 
596 aa  495  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.646576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0828  potassium-transporting ATPase subunit A  50.57 
 
 
559 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068706 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0814  potassium-transporting ATPase subunit A  50.57 
 
 
559 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4161  potassium-transporting ATPase subunit A  49.38 
 
 
564 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.222505  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2433  potassium-transporting ATPase subunit A  47.53 
 
 
586 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000446057  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0720  potassium-transporting ATPase subunit A  50 
 
 
557 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.621163  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0791  potassium-transporting ATPase subunit A  48.93 
 
 
557 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1707  potassium-transporting ATPase subunit A  49.56 
 
 
564 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260767  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0767  potassium-transporting ATPase subunit A  50.38 
 
 
559 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0724  potassium-transporting ATPase subunit A  50.19 
 
 
557 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1248  potassium-transporting ATPase subunit A  50.09 
 
 
562 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353689  normal  0.87869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00655  potassium-transporting ATPase subunit A  49.62 
 
 
557 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2938  potassium-transporting ATPase, A subunit  49.62 
 
 
557 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2480  potassium-transporting ATPase subunit A  47.8 
 
 
592 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00646  hypothetical protein  49.62 
 
 
557 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2958  potassium-transporting ATPase subunit A  49.62 
 
 
557 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1218  potassium-transporting ATPase subunit A  49.11 
 
 
562 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.924812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0551  potassium-transporting ATPase subunit A  49.9 
 
 
557 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  49.62 
 
 
559 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.515707  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  46.78 
 
 
811 aa  486  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0745  potassium-transporting ATPase subunit A  49.62 
 
 
557 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2047  potassium-transporting ATPase subunit A  47.45 
 
 
564 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.931973  normal  0.439277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1021  potassium-transporting ATPase subunit A  46.22 
 
 
602 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0722  potassium-transporting ATPase, A subunit  49.56 
 
 
576 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1982  potassium-transporting ATPase subunit A  45.79 
 
 
578 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00444877  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3486  potassium-transporting ATPase subunit A  49.73 
 
 
564 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>