More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2838 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
426 aa  854  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  59.11 
 
 
434 aa  466  1e-130  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  46.76 
 
 
417 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  46.34 
 
 
410 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  44.71 
 
 
405 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  44.71 
 
 
405 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  45.43 
 
 
446 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  47.1 
 
 
402 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  46.19 
 
 
406 aa  316  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  45.22 
 
 
403 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  48.51 
 
 
403 aa  315  1e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  45.9 
 
 
414 aa  313  4e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  45.69 
 
 
401 aa  309  6e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  44.95 
 
 
401 aa  309  7e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.12 
 
 
416 aa  308  2e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.49 
 
 
408 aa  306  4e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  47.43 
 
 
402 aa  305  8e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  46.56 
 
 
412 aa  305  1e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  46.13 
 
 
407 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.96 
 
 
400 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.78 
 
 
406 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  40.44 
 
 
412 aa  283  4e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  43.78 
 
 
402 aa  283  4e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.95 
 
 
414 aa  273  5e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  46.79 
 
 
379 aa  262  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 
410 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  34.72 
 
 
369 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.79 
 
 
417 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  37.12 
 
 
370 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  34.1 
 
 
369 aa  200  4e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  32.87 
 
 
369 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  34.52 
 
 
461 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  34.52 
 
 
461 aa  186  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  32.59 
 
 
457 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  34.78 
 
 
420 aa  184  2e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 
372 aa  182  8e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  33.41 
 
 
451 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.32 
 
 
453 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.9 
 
 
369 aa  180  3e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.08 
 
 
411 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  32.22 
 
 
408 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  34.11 
 
 
409 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  32.22 
 
 
408 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.66 
 
 
412 aa  174  3e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.66 
 
 
412 aa  174  3e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.14 
 
 
408 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.87 
 
 
408 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.64 
 
 
416 aa  170  4e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.81 
 
 
414 aa  169  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  31.59 
 
 
408 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.65 
 
 
409 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  37.4 
 
 
361 aa  167  3e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  35.14 
 
 
417 aa  167  3e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.36 
 
 
415 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.59 
 
 
408 aa  164  2e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.78 
 
 
400 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.88 
 
 
376 aa  160  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  31.25 
 
 
363 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.42 
 
 
409 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  35.05 
 
 
359 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  32.94 
 
 
407 aa  152  9e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.61 
 
 
406 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.02 
 
 
501 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  35.57 
 
 
407 aa  148  2e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.52 
 
 
405 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.82 
 
 
367 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.93 
 
 
418 aa  142  2e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.93 
 
 
418 aa  142  2e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.38 
 
 
415 aa  140  4e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.27 
 
 
418 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  31.45 
 
 
423 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  32.93 
 
 
453 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  32.21 
 
 
406 aa  129  9e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  33.02 
 
 
424 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  32.62 
 
 
427 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.98 
 
 
515 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  27.98 
 
 
1016 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.14 
 
 
409 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.7 
 
 
512 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.7 
 
 
512 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  28.61 
 
 
380 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.7 
 
 
512 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 
437 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  31.99 
 
 
419 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  30.51 
 
 
600 aa  122  2e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.67 
 
 
431 aa  120  4e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.15 
 
 
505 aa  119  8e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.39 
 
 
465 aa  119  1e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.65 
 
 
501 aa  119  1e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 
430 aa  119  1e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  32 
 
 
349 aa  118  2e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30 
 
 
428 aa  115  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30 
 
 
428 aa  115  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.82 
 
 
431 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.97 
 
 
505 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.09 
 
 
420 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  29.86 
 
 
427 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  30 
 
 
866 aa  113  7e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.8 
 
 
405 aa  112  1e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.31 
 
 
414 aa  112  1e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>