273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2742 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2742  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  303  9.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.37 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.21 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.33 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.27 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.19 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  32.19 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.48 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.48 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.88 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.66 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
149 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  29.87 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  40.79 
 
 
296 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.53 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  33.12 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  26.9 
 
 
143 aa  54.3  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
144 aa  54.3  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.79 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  24.16 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  31.54 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  29.22 
 
 
310 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  32.21 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  32.21 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  31.33 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.21 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  25 
 
 
151 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
141 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.61 
 
 
294 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.21 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  27.15 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  31.25 
 
 
310 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  31.25 
 
 
310 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  31.65 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  31.25 
 
 
310 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.45 
 
 
297 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  31.33 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.53 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.67 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  30 
 
 
310 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
297 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  31.75 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  26.97 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2106  UspA domain protein  24.68 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  29.17 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  33.77 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  35.26 
 
 
317 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  30.19 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  29.37 
 
 
310 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  26.67 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.03 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30.72 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  29.23 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  28.67 
 
 
310 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  26.35 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  25.81 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  31.25 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2112  UspA domain protein  23.33 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  32.9 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  29.8 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  28.67 
 
 
310 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  28.67 
 
 
310 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  28.67 
 
 
310 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.75 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.57 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  29.05 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  36.54 
 
 
280 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  29.92 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.92 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.53 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  25.16 
 
 
136 aa  47.8  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  25.17 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  28.67 
 
 
310 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.26 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  29.23 
 
 
310 aa  47.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  36.56 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  31.54 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  28.57 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>