More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2732 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
311 aa  617  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  57.52 
 
 
312 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  56.81 
 
 
305 aa  322  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  37.46 
 
 
323 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  35.55 
 
 
322 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  39.39 
 
 
333 aa  165  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  34.9 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  34.12 
 
 
316 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  34.9 
 
 
319 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1578  agmatinase  35.27 
 
 
318 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  35.94 
 
 
315 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  35.66 
 
 
299 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  39.03 
 
 
345 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  33 
 
 
320 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.01 
 
 
319 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  33 
 
 
320 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  33 
 
 
316 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  33 
 
 
320 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  32.57 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  34.43 
 
 
318 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  35.47 
 
 
319 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  35.02 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  35.02 
 
 
329 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  35.02 
 
 
320 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  34.1 
 
 
354 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  34.68 
 
 
318 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  34.1 
 
 
354 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  32.43 
 
 
316 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  36.03 
 
 
315 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  37.01 
 
 
304 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  34.68 
 
 
318 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.27 
 
 
315 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  38.39 
 
 
369 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  33.55 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  33.33 
 
 
345 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  33.33 
 
 
345 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  33.33 
 
 
345 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  33.66 
 
 
329 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  34 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  33.99 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  34.67 
 
 
321 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  34.12 
 
 
317 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  34.78 
 
 
318 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  33.33 
 
 
342 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  33.87 
 
 
310 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  35.79 
 
 
299 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  30.86 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  33.56 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.04 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  34.46 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  34.46 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  37.33 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  34.46 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  34.46 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  34.46 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  33.57 
 
 
293 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  35.66 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  34.45 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  35.19 
 
 
291 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  34.12 
 
 
317 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  34.53 
 
 
354 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  34.6 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  34.67 
 
 
288 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  33.88 
 
 
352 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  30.58 
 
 
288 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  35.97 
 
 
287 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  37.14 
 
 
320 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  32.61 
 
 
287 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  33.88 
 
 
319 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  33.88 
 
 
319 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  32.23 
 
 
296 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  33.88 
 
 
319 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  37.33 
 
 
334 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  29.09 
 
 
297 aa  142  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  32.43 
 
 
306 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  31.86 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  35.87 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  31.97 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  33.44 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1883  arginase family protein  32.62 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  30.77 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  32.65 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  34.49 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  34.11 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  32.89 
 
 
318 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1957  arginase family protein  32.62 
 
 
337 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  30.4 
 
 
282 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  33.67 
 
 
354 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  32.57 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  38.03 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  33.11 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  36.82 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  31.67 
 
 
401 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  32.44 
 
 
324 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  31.35 
 
 
351 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  33.7 
 
 
287 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  31.25 
 
 
318 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  31.63 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  31.63 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  31.63 
 
 
290 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>