182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2722 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  49.04 
 
 
340 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  45.66 
 
 
334 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  40.49 
 
 
338 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  32.23 
 
 
315 aa  135  6e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  30.09 
 
 
306 aa  117  2e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  5.40158e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  34.96 
 
 
713 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 
345 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  28.66 
 
 
487 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.42 
 
 
495 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 
348 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  29.14 
 
 
472 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 
325 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 
384 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.33 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  29.79 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.01 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  28.82 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  28.38 
 
 
369 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  30.26 
 
 
505 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  27.17 
 
 
327 aa  85.1  1e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 
357 aa  85.5  1e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 
644 aa  84.7  2e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  28.24 
 
 
344 aa  82.8  7e-15  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.86 
 
 
444 aa  82  1e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  32.03 
 
 
524 aa  82  1e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  28.43 
 
 
317 aa  79.7  5e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  7.24629e-05 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
345 aa  79.3  8e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
456 aa  77.8  2e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.34 
 
 
618 aa  77.4  3e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  29.09 
 
 
699 aa  77  3e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  29.54 
 
 
522 aa  76.3  7e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 
341 aa  73.9  3e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  29.47 
 
 
401 aa  73.6  4e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25.37 
 
 
509 aa  72.4  8e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  27.99 
 
 
348 aa  71.2  2e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.23 
 
 
320 aa  70.9  3e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  30.04 
 
 
313 aa  70.5  4e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  27.21 
 
 
341 aa  70.1  4e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 
501 aa  69.7  5e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.92 
 
 
367 aa  69.7  5e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 
465 aa  69.3  7e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.51 
 
 
356 aa  69.3  8e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  1.89943e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.51 
 
 
355 aa  68.6  1e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.6265e-07  hitchhiker  9.68585e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.51 
 
 
355 aa  68.6  1e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  5.32018e-05  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  30.89 
 
 
344 aa  68.2  2e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.64 
 
 
346 aa  68.2  2e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  25.96 
 
 
533 aa  67  4e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  26.07 
 
 
524 aa  66.2  7e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.15 
 
 
392 aa  66.2  7e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.76 
 
 
383 aa  66.2  7e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  27.24 
 
 
450 aa  65.5  1e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 
855 aa  65.1  1e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.41 
 
 
344 aa  65.5  1e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 
537 aa  65.5  1e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.02 
 
 
352 aa  63.9  3e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.16592e-07  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.03 
 
 
385 aa  62.4  8e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.862e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.42 
 
 
346 aa  62  1e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.41301e-10  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.96 
 
 
378 aa  61.6  1e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  26.13 
 
 
344 aa  62  1e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  6.31807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  27.96 
 
 
468 aa  61.6  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 
331 aa  62.4  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  26.97 
 
 
464 aa  62  1e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.96 
 
 
378 aa  61.6  2e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  23.53 
 
 
315 aa  61.2  2e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  27.64 
 
 
512 aa  60.8  3e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
377 aa  60.5  4e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83532e-06 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  26.34 
 
 
326 aa  60.5  4e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.69 
 
 
330 aa  60.5  4e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  28.24 
 
 
341 aa  60.5  4e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
337 aa  59.7  5e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.21 
 
 
346 aa  58.5  1e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  1.73963e-05  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.48 
 
 
341 aa  58.9  1e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.19 
 
 
316 aa  58.5  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 
315 aa  58.5  1e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.7007e-08  hitchhiker  3.5019e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.19 
 
 
316 aa  58.5  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.19 
 
 
316 aa  58.2  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.19 
 
 
316 aa  58.2  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.58 
 
 
327 aa  58.2  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.21 
 
 
340 aa  57.8  2e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.58 
 
 
316 aa  57.4  3e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 
586 aa  57.4  3e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.01 
 
 
335 aa  57  4e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.67 
 
 
316 aa  57  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  28.78 
 
 
340 aa  56.6  5e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 
315 aa  56.6  5e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.0784e-08  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 
829 aa  56.6  6e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 
350 aa  56.2  6e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.16 
 
 
337 aa  56.2  7e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.23 
 
 
577 aa  56.2  7e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  22.48 
 
 
522 aa  55.8  9e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.51 
 
 
369 aa  55.8  9e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 
472 aa  55.8  9e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.06 
 
 
357 aa  55.5  1e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
1338 aa  55.5  1e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.16 
 
 
426 aa  55.5  1e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>