21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2717 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  276  7e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  40.8 
 
 
151 aa  86.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  40.19 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  40.19 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  32.71 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  33.94 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  41.59 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  40.71 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  36.94 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  40.18 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  40.18 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  37.84 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1187  PilT domain-containing protein  45.95 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0062  hypothetical protein  33.64 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506925  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  34.71 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3272  hypothetical protein  36.79 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250729  normal  0.0598627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3025  hypothetical protein  36 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  29.13 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>