More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2580 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 173 aa  327  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  54.55 
 
 		 195 aa  150  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3017  lipoprotein signal peptidase  47.62 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  30.19 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  32.33 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  37.3 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  36.52 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  27.92 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.87 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  40.83 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  37.98 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2481  lipoprotein signal peptidase  42.16 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  39.67 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  30.52 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  36.3 
 
 		 364 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  29.52 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  36.28 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  33.12 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.6 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  27.48 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  38.27 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0688  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0410  lipoprotein signal peptidase  27.7 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  32.26 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  31.17 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>