More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2546 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  100 
 
 		 131 aa  241  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.17 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  41.74 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  43.48 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  42.28 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  37.5 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.1 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  41.27 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.53 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  37.98 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  42.19 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0149  crcB protein  44.8 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.66 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  45.79 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.71 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  38.58 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  38.84 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.71 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  48.04 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  42.62 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  48.24 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  40.83 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  38.46 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  31.5 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.5 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  42.37 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  43.1 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  39.17 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  43.1 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  38.98 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  35.45 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40.34 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36.89 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  36.36 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  51.76 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  41.76 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43.75 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  36.07 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.33 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>