102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2529 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  756    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  57.3 
 
 		 814 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  57.3 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  52.76 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  56.57 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  53.8 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  54.42 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  52.45 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  51.22 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  53.41 
 
 		 412 aa  356  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  50.14 
 
 		 783 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  51.73 
 
 		 385 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  51.07 
 
 		 382 aa  345  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  49.59 
 
 		 783 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  48.37 
 
 		 1293 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  39.01 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  28.99 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  39.18 
 
 		 741 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 		 389 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  25.98 
 
 		 434 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 385 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  33.42 
 
 		 751 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  29.4 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  39.22 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  37.21 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  37.21 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  32.89 
 
 		 754 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  32 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  27.89 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 416 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.88 
 
 		 1119 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  26.89 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  26.92 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 903 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  28.46 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 729 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.41 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.68 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.68 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 728 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 728 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 395 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 477 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 705 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.65 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  27.95 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  28.09 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  21.8 
 
 		 942 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  29.65 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  25.95 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  31.36 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  26.02 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 859 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  30.68 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  27.78 
 
 		 420 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  35.09 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  32.23 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  29.03 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.41 
 
 		 723 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.58 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  24.06 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0523  anthranilate synthase, component I  24.26 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>