98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2516 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
234 aa  464  1e-130  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 
236 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 
236 aa  124  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 
236 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  35.65 
 
 
236 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 
236 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  36.09 
 
 
236 aa  120  2e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 
288 aa  117  1e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
236 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
236 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
229 aa  111  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  34.63 
 
 
236 aa  111  1e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
232 aa  110  2e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
223 aa  108  7e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
223 aa  108  7e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
236 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  36.17 
 
 
229 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  36.17 
 
 
229 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  36.17 
 
 
229 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  36.17 
 
 
229 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  36.17 
 
 
229 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  35.74 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.48 
 
 
224 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  35.74 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  35.74 
 
 
229 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 
230 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  31.6 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  25.4 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
224 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  33.77 
 
 
220 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
211 aa  85.1  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
227 aa  83.6  2e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 
222 aa  83.6  2e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
224 aa  83.2  3e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
224 aa  83.2  3e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  24.34 
 
 
234 aa  82  7e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 
250 aa  82  8e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
222 aa  81.3  1e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
225 aa  81.3  1e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
244 aa  79  6e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  32.23 
 
 
223 aa  77.8  1e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 
224 aa  77.8  1e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 
222 aa  75.5  6e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 
225 aa  68.6  9e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 
218 aa  67.4  2e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  26.12 
 
 
271 aa  61.6  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 
231 aa  56.2  5e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
253 aa  55.5  6e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0362  phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 
210 aa  55.8  6e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.53 
 
 
158 aa  53.9  2e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
202 aa  52.8  5e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  43.53 
 
 
158 aa  51.6  1e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  25.88 
 
 
209 aa  50.4  2e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  34.52 
 
 
185 aa  50.1  3e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  37.21 
 
 
174 aa  49.3  6e-05  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  23.36 
 
 
447 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.75 
 
 
171 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  28.38 
 
 
222 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.38 
 
 
222 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.44 
 
 
161 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  28.12 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  37.74 
 
 
174 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 
200 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  40.79 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.82 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  27.82 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.07 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  23.26 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.75 
 
 
161 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  25.21 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  24.54 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  25.21 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  25.21 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
401 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
170 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  38.82 
 
 
157 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>