More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2482 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  100 
 
 
198 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  49.46 
 
 
256 aa  175  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  47.83 
 
 
259 aa  173  2e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.16146e-09 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  49.21 
 
 
237 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  45.81 
 
 
202 aa  164  1e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  41 
 
 
201 aa  163  2e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  47.62 
 
 
237 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  2.35996e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  46.6 
 
 
206 aa  158  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  47.21 
 
 
286 aa  157  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  48.65 
 
 
363 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  46.2 
 
 
221 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  44.97 
 
 
221 aa  155  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  42.78 
 
 
268 aa  155  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  45.16 
 
 
277 aa  154  5e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  43.65 
 
 
206 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  45.83 
 
 
223 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  43.24 
 
 
249 aa  151  6e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  45.11 
 
 
221 aa  150  9e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  38.59 
 
 
217 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  45.6 
 
 
222 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  43.39 
 
 
213 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  45.51 
 
 
206 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  42.7 
 
 
220 aa  148  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  41.07 
 
 
204 aa  148  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  1.22435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  46.24 
 
 
215 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  42.7 
 
 
221 aa  147  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  42.78 
 
 
219 aa  146  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  41.18 
 
 
202 aa  146  2e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  39.78 
 
 
204 aa  146  2e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  42.78 
 
 
219 aa  146  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  42.78 
 
 
219 aa  146  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  47.13 
 
 
215 aa  146  2e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  42.78 
 
 
219 aa  146  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  45.9 
 
 
215 aa  146  2e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  40.59 
 
 
202 aa  145  4e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  46.55 
 
 
228 aa  145  4e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  42.55 
 
 
219 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  42.78 
 
 
220 aa  145  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  42.77 
 
 
219 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  45.36 
 
 
216 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  42.25 
 
 
219 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.65 
 
 
194 aa  144  7e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  42.77 
 
 
219 aa  144  7e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  42.77 
 
 
219 aa  144  8e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  43.79 
 
 
219 aa  144  8e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  43.79 
 
 
219 aa  144  8e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  43.79 
 
 
219 aa  144  8e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.79 
 
 
219 aa  144  8e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  43.79 
 
 
219 aa  144  8e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  43.79 
 
 
219 aa  144  8e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  45.65 
 
 
215 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  41.49 
 
 
220 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  41.53 
 
 
221 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  45.26 
 
 
227 aa  140  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  42.86 
 
 
216 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  45.66 
 
 
215 aa  140  1e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  41.24 
 
 
206 aa  140  1e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  45.66 
 
 
215 aa  140  1e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  45.39 
 
 
220 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  45.39 
 
 
220 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  45.39 
 
 
220 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  40.43 
 
 
213 aa  138  4e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  41.67 
 
 
218 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  42.64 
 
 
237 aa  137  8e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  39.29 
 
 
216 aa  137  9e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.33 
 
 
458 aa  137  9e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  49.65 
 
 
234 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  41.57 
 
 
252 aa  135  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  37.63 
 
 
211 aa  134  6e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  39.81 
 
 
244 aa  134  6e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  44.1 
 
 
222 aa  134  6e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  39.78 
 
 
232 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.71 
 
 
229 aa  134  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  40.11 
 
 
230 aa  133  2e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.76 
 
 
226 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  40.74 
 
 
241 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  43.24 
 
 
235 aa  132  4e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.9 
 
 
209 aa  131  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  40.38 
 
 
214 aa  131  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  41.08 
 
 
220 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  45.1 
 
 
219 aa  130  1e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  45.32 
 
 
262 aa  129  2e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  37.77 
 
 
218 aa  130  2e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.09 
 
 
231 aa  130  2e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  37.89 
 
 
224 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  40.91 
 
 
221 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  42.53 
 
 
237 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  38.51 
 
 
218 aa  129  4e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  41.94 
 
 
213 aa  129  4e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  39.08 
 
 
218 aa  129  4e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  41.07 
 
 
219 aa  128  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  37.64 
 
 
245 aa  127  1e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  40.44 
 
 
244 aa  126  2e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  34.2 
 
 
220 aa  126  2e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  39.56 
 
 
215 aa  125  4e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  39.56 
 
 
215 aa  125  4e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42104e-05 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  36.02 
 
 
229 aa  125  4e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  41.03 
 
 
230 aa  125  4e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  43.82 
 
 
227 aa  125  4e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  40 
 
 
222 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>