More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2459 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  100 
 
 		 341 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  56.16 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  57.89 
 
 		 348 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  57.59 
 
 		 352 aa  331  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  56.6 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3042  Monosaccharide-transporting ATPase  53.87 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.792923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2303  inner-membrane translocator  49.85 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5276  Monosaccharide-transporting ATPase  49.57 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  45.77 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  38.17 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  39.62 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  39.3 
 
 		 861 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  40.88 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  38.92 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  38.92 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  38.92 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  38.29 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  38.82 
 
 		 322 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  36.31 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  38.78 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  39.69 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 		 317 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  33.53 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.2 
 
 		 336 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  37.28 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0392  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3074  monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  42.54 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2726  monosaccharide-transporting ATPase  40.31 
 
 		 340 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2121  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2265  Monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.29 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 		 311 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 		 311 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.29 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.95 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.95 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.75 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  35.89 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.27 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.16 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.27 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  36.39 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.85 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.85 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.96 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 345 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  37.5 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  37 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.44 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  34.42 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  36.22 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  34 
 
 		 347 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  37.97 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  31.99 
 
 		 318 aa  159  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  32.82 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>