More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2458 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 498 aa  981    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  65.59 
 
 		 516 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  64.5 
 
 		 505 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  63.73 
 
 		 509 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  64.73 
 
 		 508 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  64.49 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  64.49 
 
 		 516 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  62.04 
 
 		 500 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  59.1 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  55.71 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  50.41 
 
 		 861 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  51.72 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  51.91 
 
 		 519 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  52.31 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  52.57 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.74 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  51.22 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.53 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.7 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.31 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.18 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  48.07 
 
 		 507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  48.26 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  48.47 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  48.21 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  44.69 
 
 		 504 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  44.11 
 
 		 520 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.68 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  49.48 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46.33 
 
 		 495 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  44.11 
 
 		 509 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  47.41 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  47.66 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  47.21 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  48.08 
 
 		 537 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  47.37 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  45.84 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.44 
 
 		 525 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  47.51 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  46.25 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  45.84 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  45.81 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.75 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  47.21 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  47.21 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  44.08 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  46.12 
 
 		 518 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 		 525 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 497 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.9 
 
 		 527 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  45.19 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  47.36 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  44.69 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  47.61 
 
 		 517 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  47.01 
 
 		 513 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  47.61 
 
 		 517 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.92 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  44.81 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  47.61 
 
 		 517 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  44.79 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  43.7 
 
 		 501 aa  432  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.35 
 
 		 501 aa  428  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  43.9 
 
 		 516 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  45.42 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.69 
 
 		 524 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 523 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  42.57 
 
 		 506 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  45.1 
 
 		 524 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.69 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  45.1 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.69 
 
 		 524 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  43.9 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  42.98 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.49 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  44.47 
 
 		 502 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  45.12 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  43.9 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.9 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.46 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  42.68 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  43.88 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  48.37 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.9 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  47.01 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  47.35 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>