82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2427 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  100 
 
 
388 aa  749    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  49.16 
 
 
358 aa  272  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  42.21 
 
 
348 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  38.66 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  44.01 
 
 
363 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  43.73 
 
 
360 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  41.64 
 
 
348 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.69 
 
 
356 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.52 
 
 
379 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  41.85 
 
 
364 aa  235  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  40.76 
 
 
370 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  40.16 
 
 
372 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.73 
 
 
365 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.73 
 
 
365 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.06 
 
 
349 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  41.5 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.6 
 
 
358 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  40.96 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  38.75 
 
 
367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.55 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  40.85 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  37.07 
 
 
416 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.44 
 
 
363 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.1 
 
 
351 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  38.74 
 
 
354 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  38.46 
 
 
351 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  38.74 
 
 
354 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  38.46 
 
 
354 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  38.46 
 
 
354 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  38.19 
 
 
351 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  38.19 
 
 
351 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  38.19 
 
 
354 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.72 
 
 
364 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.78 
 
 
367 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.71 
 
 
350 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  37.78 
 
 
351 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  35.99 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  42.36 
 
 
374 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  37.91 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.14 
 
 
350 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.11 
 
 
366 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.6 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  33.51 
 
 
434 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  39.82 
 
 
331 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  36.1 
 
 
370 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  34.73 
 
 
348 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  31.25 
 
 
544 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  32.6 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  28.44 
 
 
324 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  33.33 
 
 
365 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228892 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  39.42 
 
 
742 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  34.63 
 
 
689 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  24.82 
 
 
967 aa  97.8  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  42.22 
 
 
189 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  43.05 
 
 
599 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  27.01 
 
 
481 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  25.71 
 
 
1129 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  33.83 
 
 
1344 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  27.22 
 
 
362 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  26.25 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  25.91 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  25.61 
 
 
362 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  25.32 
 
 
385 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.19 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  23.84 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  21.79 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  26.23 
 
 
385 aa  47  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  24.8 
 
 
305 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  25.39 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  25.39 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  27 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.38 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  27 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.8 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  27 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  27 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  25.39 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  27 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  27 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  27 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  21.91 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  24.84 
 
 
360 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>