More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2363 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  100 
 
 		 289 aa  578  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  54.71 
 
 		 289 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  46.08 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  46.89 
 
 		 293 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  38.1 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  38.16 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  39.05 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  35.89 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  39.63 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  36.42 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  37.72 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  39.18 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  38.69 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  38.43 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  38.46 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  35.87 
 
 		 315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  35.87 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  37.88 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  37.74 
 
 		 314 aa  161  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  36.33 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  36.82 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  34.04 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  32.62 
 
 		 318 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  36.17 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  36.17 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  36.52 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  32.26 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  35.82 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  32.51 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 328 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  32.74 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  39.58 
 
 		 303 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  29.96 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  32.97 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  30.04 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  34.35 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  33.22 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  30.77 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  30.58 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  32.75 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  33.09 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  28.52 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.18 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  28.9 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  32.46 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  29.48 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  32.03 
 
 		 404 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  33.09 
 
 		 287 aa  122  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  32.26 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  31.73 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  31.94 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 351 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  33.45 
 
 		 308 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  32.12 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.6 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  30.28 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  29.33 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  27.3 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  29.58 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  30.66 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.04 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  31.5 
 
 		 382 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.85 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.74 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  30.28 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.85 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8855  periplasmic binding protein  35.42 
 
 		 326 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.461733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  27.95 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  30.15 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  29.78 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.21 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  26.62 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.45 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  29.37 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 360 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  27.88 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  30.83 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  32.95 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 		 478 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  27.71 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  28.69 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>