More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2330 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  100 
 
 
411 aa  780    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  38.8 
 
 
408 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
411 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  39.09 
 
 
411 aa  285  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  38.68 
 
 
411 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  38.58 
 
 
411 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  39.69 
 
 
396 aa  277  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  37.65 
 
 
426 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  37.91 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  37.74 
 
 
422 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  38.69 
 
 
419 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  36.96 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  32.91 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.49 
 
 
414 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  36.34 
 
 
391 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  39.43 
 
 
415 aa  193  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
428 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  37.54 
 
 
421 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 
402 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.66 
 
 
417 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  32.99 
 
 
421 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  35.06 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  35.57 
 
 
424 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  36.14 
 
 
419 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
414 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  35.77 
 
 
416 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  33.09 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  36.27 
 
 
419 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 
397 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
408 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.87 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
407 aa  173  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  34.33 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  37.16 
 
 
417 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  36.84 
 
 
395 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  35.62 
 
 
396 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  32.43 
 
 
415 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  31.71 
 
 
412 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
426 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  34.25 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  34.38 
 
 
412 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  33.89 
 
 
397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
425 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  34.42 
 
 
412 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
408 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.98 
 
 
406 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  33.98 
 
 
406 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  36.59 
 
 
397 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  32.1 
 
 
436 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  29.95 
 
 
442 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  34.34 
 
 
398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  33.6 
 
 
418 aa  156  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  31.82 
 
 
416 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  33.7 
 
 
405 aa  155  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  30.25 
 
 
406 aa  155  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
401 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
424 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
398 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
398 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  32.04 
 
 
406 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
392 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  29.18 
 
 
424 aa  149  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  32.66 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  34.33 
 
 
424 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  34.33 
 
 
424 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  34.82 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.65 
 
 
444 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  29.59 
 
 
407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
423 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1788  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.75 
 
 
422 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
434 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  32.88 
 
 
386 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.23 
 
 
422 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  31.02 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  29.18 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
389 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19051  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.54 
 
 
423 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  37.54 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  37.54 
 
 
399 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  37.54 
 
 
399 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  31.33 
 
 
412 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  36.59 
 
 
397 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  36.31 
 
 
397 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  28.7 
 
 
449 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0271  major facilitator transporter  32.61 
 
 
429 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  30.1 
 
 
343 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  29.86 
 
 
416 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  30.37 
 
 
370 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.49 
 
 
416 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.779737  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
453 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>