More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2230 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2230  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  71.28 
 
 		 98 aa  137  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  72.34 
 
 		 98 aa  137  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 94 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 94 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 94 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  60.42 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  52.69 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 97 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 97 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1485  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00014757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2104  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00575627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  58.06 
 
 		 103 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 98 aa  104  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  62.37 
 
 		 92 aa  103  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 100 aa  103  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 99 aa  103  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 97 aa  103  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  54.26 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 98 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  54.26 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2053  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 100 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  52.69 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>