More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2218 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  100 
 
 		 433 aa  855    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.4 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.59 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.71 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.71 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  42.4 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  42.17 
 
 		 423 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.86 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  40.41 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  45.62 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  41.82 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  44.39 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.05 
 
 		 434 aa  285  9e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.92 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.18 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.15 
 
 		 491 aa  282  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.86 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.89 
 
 		 417 aa  279  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  43.28 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  42.51 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.37 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  43.02 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.27 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  41.65 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.65 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  45.92 
 
 		 509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  42.28 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.76 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.66 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  46.31 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.44 
 
 		 463 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.86 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.69 
 
 		 517 aa  265  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.29 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  38.56 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.3 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  40.77 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.33 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.67 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.79 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.75 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.87 
 
 		 333 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  41.67 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  41.67 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  43.49 
 
 		 516 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  44.32 
 
 		 519 aa  263  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  41.36 
 
 		 435 aa  263  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.09 
 
 		 368 aa  262  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.34 
 
 		 505 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.59 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  48.82 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  46.33 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  49.07 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  40.41 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.41 
 
 		 482 aa  259  6e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  43.37 
 
 		 493 aa  259  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  45.65 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  45.9 
 
 		 333 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  47.03 
 
 		 352 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.58 
 
 		 464 aa  257  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  47.87 
 
 		 338 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  47.35 
 
 		 338 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  45.05 
 
 		 509 aa  257  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  46.19 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  46.19 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  46.19 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  46.19 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  46.19 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  46.19 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  46.19 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  45.27 
 
 		 353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.22 
 
 		 680 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.23 
 
 		 340 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.34 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  48.2 
 
 		 347 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  45.88 
 
 		 338 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  44.91 
 
 		 345 aa  253  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  47.56 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  41.32 
 
 		 424 aa  252  9.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  42.12 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  50.15 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  46.75 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  46.22 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.7 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  47.59 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  45.48 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  41.78 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  48.29 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  44.97 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  42.76 
 
 		 541 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  46.76 
 
 		 338 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  39.59 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  47.62 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  47.46 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  38.9 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  49.1 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  47.38 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  45.43 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  45.43 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>