142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2087 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  100 
 
 		 119 aa  237  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  43.09 
 
 		 379 aa  100  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  40.62 
 
 		 174 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  48.51 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  43.09 
 
 		 182 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  38.46 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  36.89 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  36.89 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  36.89 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  37.5 
 
 		 226 aa  77  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  34.43 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  38.66 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  33.87 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  34.86 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  38.53 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  40 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  35.96 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  34.26 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  32.73 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  35.83 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  33.63 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  31.9 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  33.93 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  36.59 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  31.48 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  30.84 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  33.33 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  30 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  34.86 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  31.62 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  32.14 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  31.48 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  29.25 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  29.25 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  31.78 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  31.48 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  33.33 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  28.45 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  30.48 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.57 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  36.04 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  29.13 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  31.43 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  33.93 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  31.78 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  35.71 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  33.87 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  33.33 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  30.23 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  31.63 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  29.7 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  36.45 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  30.19 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  30.77 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  30 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  31.43 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  27.78 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  27.78 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  27 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  30.91 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  30.21 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  35.09 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  31.58 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  27 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  27 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  29.82 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  31.48 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  27 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  27.72 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  31.68 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  31.58 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  30.48 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  34.31 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  34.31 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  34.31 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  34.31 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  34.31 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  34.31 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  34.31 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  35.96 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  28.3 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  25.89 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  28.95 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  29.52 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  34.82 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  29 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3522  DoxX family protein  29.59 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0254213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  28.95 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  32.41 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  28.95 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  31.48 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  28.95 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3227  DoxX family protein  28.57 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  28.44 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  30.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  24.41 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>