234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2073 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
256 aa  520  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  56.17 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  49.58 
 
 
235 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  45.76 
 
 
236 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  41.74 
 
 
243 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  42.15 
 
 
243 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  42.15 
 
 
243 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  48.32 
 
 
235 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  41.74 
 
 
243 aa  208  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  42.44 
 
 
242 aa  208  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  50.72 
 
 
220 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  49.18 
 
 
239 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  41.32 
 
 
243 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  41.74 
 
 
243 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  41.32 
 
 
243 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  44.68 
 
 
235 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  48.87 
 
 
223 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  49.53 
 
 
229 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  44.92 
 
 
235 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  43.55 
 
 
244 aa  201  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  47.62 
 
 
215 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  52.63 
 
 
230 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  42.67 
 
 
234 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  42.37 
 
 
240 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  48.06 
 
 
213 aa  191  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  47.95 
 
 
250 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  43.27 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  40.25 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  41.53 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  43.15 
 
 
237 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  48.02 
 
 
209 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  43.51 
 
 
238 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  49.51 
 
 
237 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  47.37 
 
 
212 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  42.68 
 
 
237 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  42.26 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 
244 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  40.58 
 
 
213 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 
243 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 
243 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  46.67 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  40.57 
 
 
270 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  40.57 
 
 
243 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  41.25 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  37.3 
 
 
239 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 
209 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  38.2 
 
 
234 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  43.81 
 
 
211 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  44.81 
 
 
225 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 
237 aa  149  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  40.19 
 
 
231 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  39.81 
 
 
219 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 
221 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  40 
 
 
227 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
211 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  34.65 
 
 
228 aa  141  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  39.08 
 
 
231 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  38.92 
 
 
216 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
215 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  42.72 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 
217 aa  139  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 
221 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  38.1 
 
 
221 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  36.45 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  37.07 
 
 
222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  35.55 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 
215 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
203 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 
220 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  44.17 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  32.54 
 
 
214 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  38.19 
 
 
207 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  36.97 
 
 
215 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.72 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 
248 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 
221 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  34.51 
 
 
222 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
221 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  35.91 
 
 
229 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
216 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  37.81 
 
 
210 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  33.04 
 
 
232 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
227 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 
213 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 
217 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  33.8 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 
216 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
216 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  33.8 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  33.91 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 
221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>