238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2059 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
245 aa  493  1e-138  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  65.91 
 
 
228 aa  278  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  57.53 
 
 
225 aa  273  2e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
225 aa  271  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  58.9 
 
 
225 aa  270  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  56.76 
 
 
226 aa  268  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  58.08 
 
 
233 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  56.62 
 
 
225 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  56.62 
 
 
225 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  55.26 
 
 
233 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  59.17 
 
 
224 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.1363e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  56.16 
 
 
225 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  56.16 
 
 
225 aa  262  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 
225 aa  261  5e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 
225 aa  261  7e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 
225 aa  261  7e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  54.79 
 
 
225 aa  260  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 
225 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 
225 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  54.87 
 
 
235 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  58.26 
 
 
229 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  56.05 
 
 
229 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
225 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  57.21 
 
 
225 aa  254  6e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  53 
 
 
225 aa  253  2e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  56.31 
 
 
225 aa  252  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  54.63 
 
 
222 aa  249  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 
225 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  55.7 
 
 
241 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  54.67 
 
 
224 aa  249  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
240 aa  247  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.21985e-05  hitchhiker  1.31635e-09 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  57.34 
 
 
227 aa  247  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  56.46 
 
 
218 aa  246  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 
226 aa  246  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.79843e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  56.62 
 
 
232 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 
228 aa  244  1e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 
228 aa  244  1e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 
232 aa  243  2e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  56.07 
 
 
228 aa  243  2e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 
228 aa  242  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  53.67 
 
 
223 aa  242  4e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  51.12 
 
 
269 aa  241  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.1966e-11  hitchhiker  5.89305e-06 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 
268 aa  241  6e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
226 aa  240  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 
231 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 
231 aa  239  3e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 
223 aa  239  3e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  54.26 
 
 
229 aa  239  3e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  53.6 
 
 
231 aa  239  3e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  239  3e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.00069e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  54.91 
 
 
229 aa  238  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  238  6e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  56.11 
 
 
227 aa  238  7e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.21221e-06  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
224 aa  238  7e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  238  7e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  238  7e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  52.21 
 
 
247 aa  237  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  54.39 
 
 
233 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  53 
 
 
219 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 
226 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 
232 aa  236  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
226 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 
221 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  51.79 
 
 
245 aa  235  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
221 aa  235  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
230 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
230 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  52.07 
 
 
222 aa  234  1e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  53.52 
 
 
230 aa  233  2e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  54.08 
 
 
261 aa  232  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
225 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
221 aa  232  4e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
218 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 
229 aa  231  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
218 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
229 aa  232  5e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 
230 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 
230 aa  231  7e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
219 aa  231  8e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 
223 aa  230  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
219 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
222 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  54.72 
 
 
217 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.82189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 
228 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  54.71 
 
 
229 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 
228 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  52.78 
 
 
221 aa  229  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
229 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 
228 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 
230 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
218 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 
229 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
222 aa  228  7e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>