141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2013 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  100 
 
 		 330 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  67.89 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  59.2 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  57.14 
 
 		 330 aa  381  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  60.12 
 
 		 329 aa  381  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  50.47 
 
 		 319 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  48.6 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  49.54 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  46.08 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  45.23 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  45.23 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  41.16 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  42.64 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  41.49 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  41.96 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  56.45 
 
 		 198 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  46.71 
 
 		 192 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  44.07 
 
 		 197 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  59.5 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  53.72 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  51.16 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  41.21 
 
 		 210 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  50.36 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  49.62 
 
 		 141 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  52.07 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  55.86 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  42.95 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  49.59 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  50 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  50 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  46.28 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  36.95 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  51.79 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.45 
 
 		 186 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  46.51 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  44.53 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  43.75 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  46.34 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  42.98 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  49.57 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  41.92 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  51.96 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  48.03 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  48.7 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  43.8 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  43.31 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  46.67 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  46.28 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  40.77 
 
 		 344 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  43.94 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  43.94 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  41.78 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  44.35 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  47.11 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  44.8 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  41.54 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  42.52 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  39.37 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  42.86 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  41.96 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  47.83 
 
 		 127 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  43.65 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  46.09 
 
 		 120 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  45.3 
 
 		 126 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1088  hypothetical protein  66.2 
 
 		 73 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  37.67 
 
 		 242 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  45.22 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  36.11 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  42.15 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  40.8 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  36.43 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  39.53 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  37.27 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  36.43 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  43.97 
 
 		 365 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  49.47 
 
 		 121 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  37.1 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  35.66 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  34.43 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  34.39 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  35.59 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  37.3 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  35.59 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  34.43 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  35.65 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  42.73 
 
 		 144 aa  86.3  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  35.59 
 
 		 256 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  33.63 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  53.25 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  46.24 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  59.26 
 
 		 55 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 90 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  57.14 
 
 		 130 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  42.11 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  60 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  55.1 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  52.08 
 
 		 123 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  41.43 
 
 		 129 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  40.21 
 
 		 138 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  50 
 
 		 127 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>