18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1960 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  330  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  32.54 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  29.66 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  33.96 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  34.26 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  32.28 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  26.24 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  28.97 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  28.7 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.24 
 
 		 173 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 306 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  27.18 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.53 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 306 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0525  redoxin domain-containing protein  27.94 
 
 		 187 aa  40.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>