More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1863 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 95 aa  197  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  75.53 
 
 		 94 aa  155  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 91 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  78.72 
 
 		 92 aa  154  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  84.34 
 
 		 93 aa  150  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  76.74 
 
 		 93 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  74.44 
 
 		 91 aa  147  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 91 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 		 93 aa  147  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 93 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  79.52 
 
 		 93 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  78.31 
 
 		 93 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  71.28 
 
 		 94 aa  147  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 94 aa  146  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  78.31 
 
 		 92 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 		 92 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  74.44 
 
 		 92 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  145  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  78.31 
 
 		 93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  75.58 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  81.93 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  76.74 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  80.72 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  77.38 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  75.58 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 91 aa  144  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  74.44 
 
 		 92 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  73.33 
 
 		 91 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 92 aa  143  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  67.74 
 
 		 93 aa  143  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 92 aa  143  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 92 aa  143  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 		 92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  78.31 
 
 		 92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  73.26 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  73.26 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  73.26 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 		 92 aa  143  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 92 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 		 91 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  77.11 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  77.01 
 
 		 91 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0841  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 91 aa  141  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08890  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 91 aa  141  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  70 
 
 		 90 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  71.11 
 
 		 92 aa  141  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  72.22 
 
 		 91 aa  140  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  140  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  68.89 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 92 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 		 91 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  78.31 
 
 		 92 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 92 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0458  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000166272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4745  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00116021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0491  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257867  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0488  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  70 
 
 		 91 aa  140  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3905  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  139  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  73.56 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  73.56 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 95 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  73.56 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 		 92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>