More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1851 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  68.42 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  62.16 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  58.82 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  62.28 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  62.28 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  63.64 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  59.17 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  60.83 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  60.53 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2603  50S ribosomal protein L18  65.14 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000566812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  64.36 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  67.01 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  63.3 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  57.94 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  55.56 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  59.13 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  62.04 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  58.88 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  60.75 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  52.73 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1930  ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  64.21 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  64.52 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  53.91 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  54.13 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  64.21 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  64.21 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  51.24 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  60.42 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1180  50S ribosomal protein L18  66.33 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  60.42 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  61.82 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  50 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  51.35 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  58.76 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  57.29 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  57.29 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  55.08 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 124 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  56.7 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  58.76 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1217  50S ribosomal protein L18  65.31 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  51.79 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  61.96 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  53.27 
 
 		 116 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  51.89 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2802  50S ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.449731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>