More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1839 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
116 aa  228  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  65.81 
 
 
118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  56.9 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  56.03 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  54.31 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  52.59 
 
 
151 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
140 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
178 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
184 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
140 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
141 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
118 aa  121  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
141 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
175 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
140 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
137 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 
141 aa  120  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  52.59 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  54.13 
 
 
114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  56.03 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
129 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
129 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 
132 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
129 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 
146 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
127 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 
131 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
140 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
118 aa  117  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
127 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  60.87 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
155 aa  116  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
117 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
117 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  50.86 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2590  50S ribosomal protein L17  44.38 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000445959  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  56.88 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  51.72 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 
195 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
131 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  60.87 
 
 
172 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
138 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
138 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 
195 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 
195 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 
117 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
131 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
136 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  55.17 
 
 
128 aa  114  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 
131 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  53.45 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 
132 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>