235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1801 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  46.31 
 
 
539 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  42.7 
 
 
541 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  42.18 
 
 
217 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  44.17 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  43.19 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  43.19 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  37.09 
 
 
242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  42.72 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  43.19 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  39.41 
 
 
246 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  42.72 
 
 
218 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  41.71 
 
 
259 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.92 
 
 
242 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  42.72 
 
 
218 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  41.9 
 
 
534 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  42.72 
 
 
218 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  41.23 
 
 
218 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  41.23 
 
 
256 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  41.23 
 
 
218 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  41.23 
 
 
218 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  41.23 
 
 
256 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  41.23 
 
 
218 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  43.94 
 
 
531 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  43.02 
 
 
553 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  45.86 
 
 
522 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  42.13 
 
 
518 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  40.45 
 
 
539 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  41.03 
 
 
204 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  41.23 
 
 
217 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  41.23 
 
 
217 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  40.76 
 
 
256 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  40.45 
 
 
549 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  41.67 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  41.67 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  41.67 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  41.67 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  41.67 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  41.79 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  41.67 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  41.67 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  41.67 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  38.94 
 
 
218 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.65 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  42.08 
 
 
203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  45.11 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  46.51 
 
 
200 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  46.15 
 
 
218 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  44.12 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  33.33 
 
 
237 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  40.8 
 
 
218 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  35.82 
 
 
221 aa  127  9.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  40.8 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.27 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  40.8 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  40.8 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  40.8 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  44.07 
 
 
257 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  37.75 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.33 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  40.86 
 
 
231 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.33 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  30.5 
 
 
243 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  40.22 
 
 
217 aa  125  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  54.24 
 
 
258 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.68 
 
 
238 aa  125  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  41.81 
 
 
228 aa  124  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  53.33 
 
 
247 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 
237 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  43.58 
 
 
239 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  41.9 
 
 
539 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  41.32 
 
 
536 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  43.75 
 
 
218 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  42.08 
 
 
562 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  36.59 
 
 
240 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  38.97 
 
 
230 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  40.11 
 
 
220 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  41.87 
 
 
203 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  40.8 
 
 
201 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  43 
 
 
203 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  38.94 
 
 
253 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  41.71 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  31.78 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  41.24 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  33.79 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  42.44 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  50.4 
 
 
564 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  43.2 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  39.45 
 
 
240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  36.71 
 
 
233 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  41.53 
 
 
499 aa  117  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  43.26 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  34.63 
 
 
201 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 
555 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>