105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1676 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 413 aa  799    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  40.78 
 
 		 395 aa  239  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  37.59 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  26.68 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  30.33 
 
 		 397 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.68 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.79 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.42 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  31.79 
 
 		 830 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  21.77 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  28.5 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  28.6 
 
 		 775 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  25.92 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  25.92 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  28.16 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 		 193 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  26.12 
 
 		 392 aa  89.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  32.25 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  28.46 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  23.8 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  22.38 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  22.33 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  23.66 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  23.32 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  23.6 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  22.6 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  21.73 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  21.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  21.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  21.73 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  28.14 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  27.75 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1565  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000580039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.64 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 370 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  24.9 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  23.72 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  45.12 
 
 		 1106 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.84 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  44.93 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  29.1 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  51.92 
 
 		 274 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  34.45 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  27.73 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 1171 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.31 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  32.41 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  21.4 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  27.31 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  27.31 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  35.44 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  27.31 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  27.31 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  22.99 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  44.07 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  43.59 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  43.28 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  34.43 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.03 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0618  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.75 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  36.45 
 
 		 760 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  26.89 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  38.03 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  24.07 
 
 		 369 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1321  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.800168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 375 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  24.46 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  27.16 
 
 		 466 aa  43.5  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  27.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  39.13 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>