273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1597 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  100 
 
 		 416 aa  832    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  36.34 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  33.25 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  43.24 
 
 		 946 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  37.7 
 
 		 919 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  37.98 
 
 		 932 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.13 
 
 		 673 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  26.38 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  26.6 
 
 		 1036 aa  83.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  30.05 
 
 		 694 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  28.04 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  28.04 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  31.08 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  26.58 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.83 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  27.93 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  37.59 
 
 		 539 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  24.52 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  37.86 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  35.29 
 
 		 658 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  39.2 
 
 		 581 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  39.2 
 
 		 581 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  35.09 
 
 		 643 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  33.77 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  33.77 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  32.12 
 
 		 622 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  31.95 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  41.07 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  37.29 
 
 		 641 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  41.07 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  35.67 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  33.55 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  35.83 
 
 		 604 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  30.46 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  27.38 
 
 		 255 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  34.31 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  32.89 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  34.96 
 
 		 629 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  28.26 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  37.7 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  38.32 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  37.38 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  39.09 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  36.29 
 
 		 606 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  34.31 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  30.25 
 
 		 593 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  29.58 
 
 		 591 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  37.96 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  38.18 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  38.18 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  31.82 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  34.19 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  34.19 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  38.18 
 
 		 528 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  35.48 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  35.48 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  34.95 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  37.89 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.04 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  41.67 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  50 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  35.05 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  34.41 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  35.05 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  34.41 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  34.41 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  35.05 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  50 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  34.41 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  35.05 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  35.48 
 
 		 717 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  32.79 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  33.33 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  47.46 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  35.92 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  33.9 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  35.11 
 
 		 600 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  38.57 
 
 		 859 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  39.29 
 
 		 1821 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  34.43 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  47.06 
 
 		 935 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  33.33 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  32.52 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1787  S-layer protein  36.14 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  52.08 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1926  S-layer protein  36.14 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000888894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1962  putative S-layer protein  36.14 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000041962 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  31.11 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  33.1 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  34.09 
 
 		 862 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  31.18 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  34.09 
 
 		 862 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  33.93 
 
 		 548 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  42.25 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  37.66 
 
 		 760 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  38.57 
 
 		 861 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1744  S-layer protein  35.14 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000139139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>