222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1583 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  100 
 
 
458 aa  901    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  42.7 
 
 
446 aa  359  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  45.21 
 
 
445 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  45.18 
 
 
446 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  43.27 
 
 
447 aa  348  9e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  41.44 
 
 
447 aa  344  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  43.37 
 
 
443 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  40.81 
 
 
447 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  40.32 
 
 
447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  40.32 
 
 
447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  39.86 
 
 
447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  40.09 
 
 
447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  40.09 
 
 
447 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  40.09 
 
 
447 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  40.09 
 
 
447 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  40.13 
 
 
447 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  42.95 
 
 
441 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  40.32 
 
 
447 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  44.35 
 
 
444 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  42.38 
 
 
447 aa  325  7e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  41.22 
 
 
446 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  41.44 
 
 
446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  40.8 
 
 
450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  43.75 
 
 
446 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  40.45 
 
 
449 aa  305  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  41.7 
 
 
443 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  38.67 
 
 
451 aa  299  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.04 
 
 
454 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  39.36 
 
 
443 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  39.91 
 
 
453 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  39.02 
 
 
444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  44.57 
 
 
431 aa  286  5e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  39.55 
 
 
439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  38.26 
 
 
439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  39.33 
 
 
439 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  39.33 
 
 
439 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  39.33 
 
 
439 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  37.53 
 
 
454 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  39.33 
 
 
439 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.32 
 
 
442 aa  282  8.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  41.07 
 
 
445 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  38.76 
 
 
454 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  39.33 
 
 
439 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  39.73 
 
 
455 aa  280  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  38.11 
 
 
453 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  37.87 
 
 
454 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  39.25 
 
 
454 aa  279  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  41.53 
 
 
443 aa  279  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  40.93 
 
 
471 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  40.59 
 
 
454 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  38.55 
 
 
455 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  37.87 
 
 
454 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  38.94 
 
 
453 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  38.72 
 
 
453 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  39.19 
 
 
439 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  39.19 
 
 
439 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  38.32 
 
 
453 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  38.03 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  37.64 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  38.48 
 
 
457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  39.19 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  41.78 
 
 
456 aa  274  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.44 
 
 
453 aa  272  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.8 
 
 
430 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.26 
 
 
633 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  41.2 
 
 
447 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1488  K+ transporter Trk  42.25 
 
 
453 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.93 
 
 
435 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  39.44 
 
 
458 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.19 
 
 
455 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  40.41 
 
 
443 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.93 
 
 
435 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.53 
 
 
447 aa  271  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  39.58 
 
 
420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  40 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.85 
 
 
417 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.09 
 
 
448 aa  269  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  38.78 
 
 
443 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.82 
 
 
452 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  41.08 
 
 
444 aa  266  5.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  38.27 
 
 
453 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  39.91 
 
 
457 aa  266  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  36.98 
 
 
586 aa  266  7e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.28 
 
 
456 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.42 
 
 
446 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  38.69 
 
 
447 aa  265  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  45.28 
 
 
474 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  39.72 
 
 
422 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  36.68 
 
 
586 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.8 
 
 
616 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  36.82 
 
 
441 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  40 
 
 
443 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  36.87 
 
 
449 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  38.24 
 
 
469 aa  256  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.52 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  38.63 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.57 
 
 
442 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3973  sodium transporter family protein  37.39 
 
 
449 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  36.98 
 
 
574 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24340  Trk-type K+ transport system, membrane component  37.97 
 
 
471 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>