More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1577 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 587 aa  1180    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  52.79 
 
 		 598 aa  601  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  55.29 
 
 		 558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  42.92 
 
 		 720 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  43.67 
 
 		 573 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  45.05 
 
 		 584 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  39.75 
 
 		 609 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  43.6 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  44.1 
 
 		 596 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  42.25 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  42.25 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  44.32 
 
 		 584 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  42.25 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  44.55 
 
 		 584 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  43.6 
 
 		 586 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  43.68 
 
 		 608 aa  364  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  40.24 
 
 		 595 aa  359  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  39.48 
 
 		 644 aa  356  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  40.23 
 
 		 604 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  42.36 
 
 		 574 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  40 
 
 		 611 aa  352  1e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  38.86 
 
 		 569 aa  351  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  38.86 
 
 		 569 aa  350  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  38.53 
 
 		 569 aa  349  9e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  42.63 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  38.9 
 
 		 592 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  40.09 
 
 		 557 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 579 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  345  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  40.83 
 
 		 557 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  38.22 
 
 		 591 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  40.48 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3478  30S ribosomal protein S1  38.57 
 
 		 598 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.199022  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  38.63 
 
 		 570 aa  343  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  38.63 
 
 		 570 aa  343  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  38.22 
 
 		 588 aa  343  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  40.55 
 
 		 573 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  37.58 
 
 		 593 aa  342  8e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  38.44 
 
 		 575 aa  342  9e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  39.82 
 
 		 573 aa  342  9e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  39.17 
 
 		 570 aa  342  1e-92  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  41.35 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  41.26 
 
 		 559 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  37.76 
 
 		 592 aa  341  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  40.94 
 
 		 569 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  41.01 
 
 		 559 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  38.7 
 
 		 570 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  38.24 
 
 		 597 aa  340  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1951  30S ribosomal protein S1  37.58 
 
 		 606 aa  340  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275526  normal  0.0589831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  38.06 
 
 		 591 aa  339  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  41.69 
 
 		 559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  41.69 
 
 		 559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0349  30S ribosomal protein S1  38.9 
 
 		 586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000135822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  40.04 
 
 		 571 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  39 
 
 		 566 aa  337  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  37.33 
 
 		 599 aa  337  5e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  39.34 
 
 		 586 aa  337  5e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  40.57 
 
 		 560 aa  337  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  38.36 
 
 		 582 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  41.49 
 
 		 558 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  38.51 
 
 		 566 aa  336  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  38.37 
 
 		 561 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  38.37 
 
 		 561 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  41.49 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  41.49 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  38.46 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  41.49 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  36.16 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  38.22 
 
 		 589 aa  335  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  39.69 
 
 		 560 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  39.46 
 
 		 589 aa  334  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  39.69 
 
 		 558 aa  334  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  39.37 
 
 		 571 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  40.13 
 
 		 562 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  42.96 
 
 		 559 aa  333  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  39.37 
 
 		 577 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  39.37 
 
 		 570 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 576 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  39.37 
 
 		 576 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  37 
 
 		 577 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  42.31 
 
 		 555 aa  332  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 576 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  39.15 
 
 		 576 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  39.91 
 
 		 562 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  39.91 
 
 		 564 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  38.15 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  39.63 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>