More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1568 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 47 aa  94  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  85.11 
 
 		 48 aa  79  0.00000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  82.98 
 
 		 52 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  76.6 
 
 		 55 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 		 44 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 		 44 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 		 44 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 46 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  84.09 
 
 		 44 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 46 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  74.47 
 
 		 48 aa  68.6  0.00000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 52 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 		 46 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  72.34 
 
 		 51 aa  67  0.00000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  77.27 
 
 		 44 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  74.47 
 
 		 53 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  72.34 
 
 		 52 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  72.34 
 
 		 50 aa  65.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 51 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 51 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 53 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2400  50S ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 51 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.84341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 53 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 52 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 45 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  71.74 
 
 		 53 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 53 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 52 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 51 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  61.7 
 
 		 53 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 47 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 47 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  65.96 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 45 aa  60.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  67.39 
 
 		 53 aa  60.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4593  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000549229  decreased coverage  0.0000848449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2334  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5111  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 45 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 52 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3379  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>