188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1533 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  100 
 
 
213 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  50 
 
 
201 aa  191  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  51.49 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  48.02 
 
 
213 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  47.03 
 
 
213 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  43.07 
 
 
209 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  43.07 
 
 
209 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  43 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  41.9 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  43.41 
 
 
213 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  41.55 
 
 
213 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  41.09 
 
 
213 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  41.55 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  41.09 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  41.55 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  39.9 
 
 
209 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  42.5 
 
 
209 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  39.72 
 
 
227 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  41.55 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  43.07 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  39.41 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  38.92 
 
 
209 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  38.92 
 
 
209 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  42 
 
 
221 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  43.63 
 
 
242 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  43 
 
 
242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  38.92 
 
 
209 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  41.09 
 
 
219 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  43.33 
 
 
213 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  38.92 
 
 
209 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  43.33 
 
 
213 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  43.33 
 
 
213 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  43.33 
 
 
213 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  38.92 
 
 
209 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  38.92 
 
 
209 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  38.92 
 
 
209 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  38.92 
 
 
209 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  42.79 
 
 
255 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  42.65 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  38.42 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  42.57 
 
 
209 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  42 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  42.08 
 
 
226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  41.43 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  38.12 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  35.96 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  38.31 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  36.45 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  38.5 
 
 
223 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  37.86 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  38.24 
 
 
237 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  37.44 
 
 
223 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  34.62 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  39.23 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  34.62 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  35.61 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  35.61 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  33.82 
 
 
210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  35.58 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  30.24 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  35.92 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  29.13 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  34.78 
 
 
203 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  33.02 
 
 
215 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  37.02 
 
 
207 aa  101  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  32.86 
 
 
216 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  31.19 
 
 
190 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  30.48 
 
 
216 aa  98.6  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  27.01 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  33 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  32.61 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  32.85 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  39.17 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  33.98 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  35.05 
 
 
213 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  35.63 
 
 
216 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  34.27 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  30.85 
 
 
176 aa  87  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.54 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  33.88 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  33.81 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  33 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  33.91 
 
 
377 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  29.95 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  33.17 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  35.02 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  31.49 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  25.98 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  29.72 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  28.26 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  28.74 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  33.95 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  33.18 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.59 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  30.73 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  28.92 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.33 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  23.41 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  28.04 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.92 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>