175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1529 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  303  5.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  48.03 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  48.03 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  48.03 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  49.65 
 
 		 159 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  48.68 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  44.44 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  45.95 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  46.71 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  43.59 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.86 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  46.31 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  40.26 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  39.22 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  37.82 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  47.22 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  36.77 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  43.92 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.92 
 
 		 173 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.92 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  38.13 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.75 
 
 		 196 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.29 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  36.08 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  37.76 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.13 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  33.12 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.22 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.33 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  35.57 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  34.81 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.22 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.29 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.59 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  35.77 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  33.1 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.01 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  30.07 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  27.81 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.32 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.86 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  54.39 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  27.74 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.04 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  33.08 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.44 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.06 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.95 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  34.93 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  27.12 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  36.24 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  27.74 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  33.55 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.03 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.72 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  34.64 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.67 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  29.68 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.46 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.96 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  30.6 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  30.6 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.6 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.83 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.93 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  31.18 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  26.52 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  32 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  29.66 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  32.35 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.86 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  34.53 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  34.53 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  34.53 
 
 		 172 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  27.08 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  31.97 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  32.47 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  34.72 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.56 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.95 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  27.78 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  30 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  25.29 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  31.08 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.69 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  26.71 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  30 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  30 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  26 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  28.36 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  28.19 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.38 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>