More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1509 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  64.85 
 
 		 174 aa  224  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  56.91 
 
 		 173 aa  214  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  51.74 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  51.53 
 
 		 179 aa  184  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.18 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.43 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  49.42 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  52.66 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  49.12 
 
 		 195 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 351 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 357 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  47.03 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  45.23 
 
 		 329 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  47.98 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  51.5 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  49.45 
 
 		 238 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  49.45 
 
 		 238 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  49.45 
 
 		 238 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  50.9 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  50.9 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  47.51 
 
 		 415 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  49.4 
 
 		 197 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  43.08 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 166 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 166 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 166 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  48.48 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 166 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  49.7 
 
 		 243 aa  174  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 182 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 166 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  48.15 
 
 		 401 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  47.62 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  50.56 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 170 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  52.73 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  50 
 
 		 154 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  45.41 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  48.78 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  52.29 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 356 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 165 aa  168  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 175 aa  167  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  47.31 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  50.31 
 
 		 168 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  49.42 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 174 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  45.29 
 
 		 178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  51.35 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  45.36 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  50.98 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  47.09 
 
 		 249 aa  161  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  45.18 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  43.83 
 
 		 164 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 154 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0752  translation initiation factor IF-3  47.74 
 
 		 168 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  43.26 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 176 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  46.39 
 
 		 171 aa  157  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 		 145 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 175 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 169 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>