73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1484 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1484  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  159  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00652286  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2277  hypothetical protein  49.3 
 
 
72 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0054158  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  43.66 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  40.98 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1665  RNA-binding protein  44.93 
 
 
75 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00331015  hitchhiker  0.0035897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0657  hypothetical protein  43.06 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000412714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1288  RNA-binding protein  43.48 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5906  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  40.28 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  38.89 
 
 
81 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  38.89 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2673  RNA-binding protein  40.28 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0307943  hitchhiker  0.000000249091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  37.88 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09980  RNA-binding protein (KH domain)  46.55 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.4486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  37.7 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  39.73 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  47.76 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  40.98 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  40.98 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  34.72 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  41.54 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  37.5 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12922  hypothetical protein  44 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.856852  normal  0.613221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  43.08 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  42.67 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  42.67 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  42.67 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  42.67 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  42.67 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11050  RNA-binding protein (KH domain)  38.96 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506658  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1560  RNA-binding protein  41.54 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0831203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2539  hypothetical protein  41.67 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160005  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  45.9 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  43.08 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10980  predicted RNA-binding protein (contains KH domain)  37.8 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000425582  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  37.7 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  37.7 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  37.7 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  41.54 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  45.76 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  58.54 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1471  KH domain protein  45.9 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0670497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  37.7 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  44.64 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2024  hypothetical protein  39.39 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000350692  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  37.5 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2873  RNA-binding protein  35.06 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0567  hypothetical protein  34.48 
 
 
75 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000283736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1168  RNA-binding protein (KH domain)  45.45 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  40.58 
 
 
100 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  41.67 
 
 
78 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  37.7 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  37.7 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0298  hypothetical protein  44.07 
 
 
79 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000067955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0541  RNA-binding protein  34.48 
 
 
75 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338376  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0995  hypothetical protein  34.55 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.889011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3593  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2886  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  32.31 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  40.98 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2407  RNA binding protein  34.85 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  37.5 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_506  hypothetical protein  34.43 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000251154  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  34.43 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1662  RNA-binding protein  41.27 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000201798  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1802  hypothetical protein  40.35 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.116861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5925  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1144  hypothetical protein  35.38 
 
 
128 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0142983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  36.67 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23740  RNA-binding protein (KH domain)  42.37 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.860329  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  40  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>