68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1450 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  100 
 
 
336 aa  634    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  40 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  26.09 
 
 
227 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  26.09 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  26.09 
 
 
237 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  26.71 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  44.58 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  29.53 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  29.53 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  28.65 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  32.35 
 
 
432 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  29.53 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  29.53 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  25.85 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  28.57 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  29.53 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.25 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.93 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  27.45 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.73 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  29.53 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  29.53 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  34.04 
 
 
237 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  32.93 
 
 
237 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  30.11 
 
 
246 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  36.27 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  35.42 
 
 
192 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  26.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  26.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  26.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  30.73 
 
 
241 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  29.91 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  32.97 
 
 
238 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  30 
 
 
292 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  32.61 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  32.61 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  32.61 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  29.17 
 
 
235 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  30.85 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  30.85 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1134  abortive infection protein  30.36 
 
 
197 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000223923 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  39.08 
 
 
253 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  28.83 
 
 
338 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  31.48 
 
 
269 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  32.99 
 
 
193 aa  46.6  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  30.93 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  26.35 
 
 
221 aa  46.6  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  29.77 
 
 
830 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  33.33 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1586  Abortive infection protein  31.4 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.099393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  27.41 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  29.17 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  32.97 
 
 
453 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  29.35 
 
 
234 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  36.56 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  24 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  33.68 
 
 
458 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  33.98 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  34.18 
 
 
224 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  28.49 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  25.96 
 
 
775 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2373  abortive infection protein  29.75 
 
 
359 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  35 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1491  Abortive infection protein  30.58 
 
 
359 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0494011  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  27.49 
 
 
196 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4727  CAAX amino terminal protease family protein  26.09 
 
 
237 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.972237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4711  CAAX amino terminal protease family protein  27.04 
 
 
237 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0300594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>