More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1326 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  100 
 
 		 464 aa  874    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 459 aa  362  6e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  44.16 
 
 		 438 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  47.26 
 
 		 436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  47.03 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  48.86 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 437 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  43.54 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  37.42 
 
 		 447 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 451 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 473 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  38.73 
 
 		 485 aa  242  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  38.1 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.93 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  37.25 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  42.9 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  37.15 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  39.47 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 474 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 474 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 474 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 474 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  38.08 
 
 		 449 aa  216  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.36 
 
 		 399 aa  216  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 473 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.36 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.36 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  37.14 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  35.76 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  36.16 
 
 		 478 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  36.16 
 
 		 478 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  36.16 
 
 		 478 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  36.16 
 
 		 478 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  36.16 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  36.16 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  35.94 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 457 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 456 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  35.94 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 422 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.6 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 382 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 435 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  31.03 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  32.53 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  29.61 
 
 		 579 aa  169  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.289204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.92 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.21 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 372 aa  163  7e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 450 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 487 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 485 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.78 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  31.32 
 
 		 576 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 485 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  37.35 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>