30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1316 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  100 
 
 		 426 aa  857    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  54.86 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  55.09 
 
 		 311 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  50 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  48.69 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  44.75 
 
 		 287 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  50.3 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  48.21 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  43.69 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.39656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  45.78 
 
 		 196 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  32.12 
 
 		 456 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  32.12 
 
 		 456 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  29.56 
 
 		 684 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.49 
 
 		 892 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  37.78 
 
 		 652 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  35.29 
 
 		 654 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  34.44 
 
 		 642 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  30.25 
 
 		 316 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 657 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1609  S-layer-like protein array-related protein-like protein  27.52 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  44.83 
 
 		 928 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2901  hypothetical protein  23.91 
 
 		 274 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000575173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  27.87 
 
 		 967 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2071  hypothetical protein  29.63 
 
 		 296 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.686043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  32.97 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  30.95 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  29.41 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  29.41 
 
 		 699 aa  43.1  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>