More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1284 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  57.77 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  58.17 
 
 		 250 aa  288  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  57.25 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  50.8 
 
 		 249 aa  272  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  52.21 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  51 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  51 
 
 		 266 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  51.79 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  53.36 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  53.36 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  49.6 
 
 		 269 aa  259  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  53.36 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  51.19 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  51 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  51.39 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  51.79 
 
 		 262 aa  256  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  48.61 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  52.8 
 
 		 255 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  52.19 
 
 		 270 aa  254  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 274 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  48.4 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  47.22 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  48.61 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 261 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  48.61 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  49.6 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  51.39 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  52.16 
 
 		 263 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  49 
 
 		 258 aa  248  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  47.6 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  48.21 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 274 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  49.8 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  49.8 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  51.59 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  48.8 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  47.81 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  48.21 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  49.4 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  46.03 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  46.22 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 272 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 		 258 aa  245  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 284 aa  244  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>