254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1233 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000841958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1476  protein of unknown function DUF150  48.23 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000465706  unclonable  0.0000025252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1931  hypothetical protein  44.97 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000150217  decreased coverage  0.000000000468182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  41.82 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  32.09 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  37.4 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  35.2 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  31.88 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  34.11 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  32.64 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  28.68 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  35.11 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  37.76 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1413  hypothetical protein  27.64 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000509228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  28.99 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  31.88 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  31.88 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  31.88 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  31.88 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  29.71 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  35.2 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  31.16 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  33.85 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  34.35 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  35.16 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  34.35 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  34.35 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  34.35 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  34.35 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  32 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  34.34 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  34.34 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  28.26 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  34.38 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  31.34 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  38.04 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  32.82 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  30.43 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  31.01 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  42.22 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  32.06 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  36.22 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  31.54 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  31.47 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  26.92 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  38.1 
 
 		 286 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  33.88 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  31.63 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  32.32 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  26.12 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  41.94 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  32.32 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  39.82 
 
 		 219 aa  60.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  28.95 
 
 		 209 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  35.79 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  31.31 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  31.31 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  35.24 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  31.58 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  30.07 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  29.46 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  36.43 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  29.29 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  30.97 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  31.63 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  26.52 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  37.62 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  31.78 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  33.08 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  32.06 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>