More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1209 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  65.25 
 
 		 235 aa  312  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  65.38 
 
 		 235 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  62.98 
 
 		 237 aa  308  8e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  63.14 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  64.26 
 
 		 237 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 235 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  61.54 
 
 		 239 aa  298  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  62.98 
 
 		 237 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  59.83 
 
 		 235 aa  292  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  59.57 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  57.26 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  58.12 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  61.44 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  58.72 
 
 		 236 aa  287  9e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  59.57 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  60.43 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.4 
 
 		 234 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  58.55 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  58.3 
 
 		 235 aa  279  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  57.26 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  57.69 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  56.6 
 
 		 236 aa  275  6e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  57.69 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 236 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  57.26 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  58.55 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  58.12 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  57.26 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.41 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.45 
 
 		 234 aa  268  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  56.36 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 237 aa  268  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  57.45 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  55.51 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.93 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  55.51 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  53.62 
 
 		 237 aa  265  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  52.32 
 
 		 238 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  57.02 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  56.22 
 
 		 244 aa  264  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  54.96 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  52.14 
 
 		 238 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  55.56 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.99 
 
 		 236 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  53.33 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  53.33 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 237 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  51.48 
 
 		 238 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  56.07 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 235 aa  258  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  55.19 
 
 		 247 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.06 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.06 
 
 		 238 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  52.03 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.06 
 
 		 238 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  54.7 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.06 
 
 		 238 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.06 
 
 		 238 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  53.85 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.06 
 
 		 238 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.06 
 
 		 238 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  51.67 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.34 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.34 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  55.13 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.34 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  55.98 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  55.74 
 
 		 233 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  55.56 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  57.26 
 
 		 234 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  51.28 
 
 		 235 aa  255  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  52.99 
 
 		 236 aa  254  8e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  54.89 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  51.49 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  54.7 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  55.56 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.48 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  48.61 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  59.15 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>