More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1122 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1559  aspartyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 580 aa  655    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492536  normal  0.0218748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1122  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 577 aa  1161    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 		 580 aa  681    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 597 aa  588  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 590 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 592 aa  578  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 585 aa  578  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 600 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 617 aa  571  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 602 aa  566  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 594 aa  568  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 586 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 591 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 589 aa  568  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 591 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 614 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 596 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 627 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 592 aa  555  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 601 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 594 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 598 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 600 aa  557  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 593 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 602 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 599 aa  553  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 590 aa  551  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 597 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 589 aa  552  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 593 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 623 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 595 aa  555  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 592 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 598 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 623 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 613 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 588 aa  552  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 605 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 606 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 599 aa  551  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 588 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 600 aa  549  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 590 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 599 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 618 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 592 aa  546  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 583 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 597 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 600 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 600 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 592 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 600 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 583 aa  545  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 599 aa  545  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 602 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 595 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 601 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 592 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 600 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 598 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 600 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 591 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 600 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 593 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 608 aa  537  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 600 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1230  aspartyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 576 aa  537  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 602 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 600 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 600 aa  538  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 600 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 599 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 605 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>