More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1109 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  46.67 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 301 aa  131  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  37.23 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  37.22 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 368 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 		 303 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.5 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.43 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.98 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.79 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.67 
 
 		 296 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.4 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.86 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.4 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  29.8 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.29 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.09 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.6 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  33.33 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  21.1 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  29.84 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  20.25 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  23.87 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.8 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  25.54 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.66 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.66 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  24.73 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.82 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.66 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  21.1 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  28.46 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  28.46 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.4 
 
 		 562 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  20.68 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  20.68 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  41.59 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.7 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.7 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  28.35 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  28.35 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  34.55 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  28.35 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>