More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1102 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  61.43 
 
 
217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  62.38 
 
 
217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  56.81 
 
 
213 aa  263  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  56.07 
 
 
216 aa  263  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  60.66 
 
 
219 aa  262  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  57.82 
 
 
216 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  54.5 
 
 
215 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  57.35 
 
 
216 aa  258  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  54.03 
 
 
215 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  57.14 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  57.14 
 
 
223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  52.63 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  52.63 
 
 
215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  54.5 
 
 
215 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  53.08 
 
 
214 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  55.92 
 
 
217 aa  250  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  52.15 
 
 
215 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  55.45 
 
 
215 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  54.98 
 
 
215 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  54.98 
 
 
215 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  54.98 
 
 
215 aa  248  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  54.98 
 
 
215 aa  248  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  54.98 
 
 
215 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  54.98 
 
 
215 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  54.98 
 
 
215 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  53.55 
 
 
215 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  51.89 
 
 
213 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  52.13 
 
 
214 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  54.5 
 
 
215 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  52.15 
 
 
215 aa  247  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  54.98 
 
 
217 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  53.55 
 
 
215 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  55.92 
 
 
217 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  53.08 
 
 
217 aa  245  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  51.42 
 
 
213 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  55.92 
 
 
217 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  54.03 
 
 
214 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  53.59 
 
 
214 aa  244  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  55.92 
 
 
217 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  53.11 
 
 
214 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  50.72 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  55.66 
 
 
217 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  54.07 
 
 
221 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  53.55 
 
 
217 aa  241  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  48.34 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  54.5 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  55.61 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  50.7 
 
 
216 aa  241  9e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  54.5 
 
 
213 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  54.5 
 
 
217 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  55.45 
 
 
214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  48.34 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  54.38 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  51.2 
 
 
217 aa  238  5e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  51.18 
 
 
214 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  51.66 
 
 
221 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  50.71 
 
 
214 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  52.36 
 
 
226 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  51.18 
 
 
217 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  53.55 
 
 
219 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  55.92 
 
 
217 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  54.98 
 
 
215 aa  235  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  52.13 
 
 
217 aa  234  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  52.13 
 
 
217 aa  234  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  54.63 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  54.59 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  50.71 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  51.66 
 
 
215 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  52.88 
 
 
217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  51.18 
 
 
217 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0859  transaldolase  50.47 
 
 
218 aa  231  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  54.59 
 
 
222 aa  231  9e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  54.03 
 
 
217 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  57.35 
 
 
218 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  46.41 
 
 
215 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  50.24 
 
 
217 aa  229  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  45.66 
 
 
222 aa  228  6e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1807  putative translaldolase  51.66 
 
 
216 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  53.7 
 
 
223 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  48.42 
 
 
218 aa  226  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  49.53 
 
 
216 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  50.7 
 
 
221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  52.56 
 
 
220 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1224  putative translaldolase  52.13 
 
 
219 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2213  putative translaldolase  51.66 
 
 
219 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0561  putative translaldolase  51.66 
 
 
219 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  51.9 
 
 
217 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  52.29 
 
 
226 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2390  putative translaldolase  50.24 
 
 
217 aa  222  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  51.83 
 
 
222 aa  221  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1087  transaldolase  50.23 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000179872  hitchhiker  0.0000000000000152073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3409  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3386  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.433866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3179  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.319562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3080  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3399  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1846  putative translaldolase  49.54 
 
 
222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3430  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3411  putative translaldolase  50 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>